Protein–RNA interactions for Protein: Q15758

SLC1A5, Neutral amino acid transporter B(0), humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A5Q15758 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC1A5Q15758 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC1A5Q15758 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC1A5Q15758 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.4 ms