Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SKIV2LQ15477 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKIV2LQ15477 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms