Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SHPRHQ149N8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
SHPRHQ149N8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SHPRHQ149N8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SHPRHQ149N8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SHPRHQ149N8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SHPRHQ149N8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SHPRHQ149N8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SHPRHQ149N8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SHPRHQ149N8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SHPRHQ149N8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SHPRHQ149N8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
SHPRHQ149N8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SHPRHQ149N8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SHPRHQ149N8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
SHPRHQ149N8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SHPRHQ149N8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SHPRHQ149N8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SHPRHQ149N8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SHPRHQ149N8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SHPRHQ149N8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
SHPRHQ149N8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SHPRHQ149N8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SHPRHQ149N8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SHPRHQ149N8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SHPRHQ149N8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SHPRHQ149N8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SHPRHQ149N8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SHPRHQ149N8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SHPRHQ149N8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SHPRHQ149N8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
SHPRHQ149N8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SHPRHQ149N8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC30.45■■■□□ 2.46
SHPRHQ149N8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SHPRHQ149N8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SHPRHQ149N8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SHPRHQ149N8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SHPRHQ149N8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SHPRHQ149N8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SHPRHQ149N8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
SHPRHQ149N8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SHPRHQ149N8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SHPRHQ149N8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SHPRHQ149N8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SHPRHQ149N8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SHPRHQ149N8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SHPRHQ149N8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SHPRHQ149N8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SHPRHQ149N8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SHPRHQ149N8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SHPRHQ149N8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SHPRHQ149N8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SHPRHQ149N8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SHPRHQ149N8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SHPRHQ149N8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SHPRHQ149N8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SHPRHQ149N8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SHPRHQ149N8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SHPRHQ149N8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SHPRHQ149N8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SHPRHQ149N8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SHPRHQ149N8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
SHPRHQ149N8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SHPRHQ149N8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SHPRHQ149N8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SHPRHQ149N8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SHPRHQ149N8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SHPRHQ149N8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SHPRHQ149N8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SHPRHQ149N8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SHPRHQ149N8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SHPRHQ149N8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
SHPRHQ149N8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SHPRHQ149N8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SHPRHQ149N8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SHPRHQ149N8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SHPRHQ149N8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SHPRHQ149N8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SHPRHQ149N8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SHPRHQ149N8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SHPRHQ149N8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SHPRHQ149N8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SHPRHQ149N8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SHPRHQ149N8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SHPRHQ149N8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SHPRHQ149N8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SHPRHQ149N8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SHPRHQ149N8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.45
SHPRHQ149N8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
SHPRHQ149N8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SHPRHQ149N8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SHPRHQ149N8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SHPRHQ149N8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SHPRHQ149N8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SHPRHQ149N8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SHPRHQ149N8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SHPRHQ149N8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SHPRHQ149N8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SHPRHQ149N8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SHPRHQ149N8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
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