Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSPNQ14714 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSPNQ14714 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
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