Protein–RNA interactions for Protein: Q14527

HLTF, Helicase-like transcription factor, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLTFQ14527 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.732e-6■■□□□ 13.1
HLTFQ14527 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.532e-6■■□□□ 13.1
HLTFQ14527 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.42e-6■■□□□ 13.1
HLTFQ14527 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.382e-6■■□□□ 13.1
HLTFQ14527 CREBZF-203ENST00000525639 2850 ntTSL 519.79■□□□□ 0.769e-7■■□□□ 13.1
HLTFQ14527 CREBZF-202ENST00000490820 4329 ntTSL 1 (best)16.2■□□□□ 0.189e-7■■□□□ 13.1
HLTFQ14527 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.039e-7■■□□□ 13.1
HLTFQ14527 CREBZF-208ENST00000531515 724 ntTSL 314.26□□□□□ -0.139e-7■■□□□ 13.1
HLTFQ14527 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.399e-7■■□□□ 13.1
HLTFQ14527 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.323e-7■■□□□ 13.1
HLTFQ14527 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.723e-7■■□□□ 13.1
HLTFQ14527 PHF14-214ENST00000521747 2479 ntTSL 224.71■■□□□ 1.554e-7■■□□□ 13.1
HLTFQ14527 PHF14-202ENST00000423760 2627 ntTSL 223.63■■□□□ 1.374e-7■■□□□ 13.1
HLTFQ14527 PHF14-206ENST00000476009 1044 ntTSL 318.91■□□□□ 0.624e-7■■□□□ 13.1
HLTFQ14527 PHF14-210ENST00000490957 4058 ntTSL 517.14■□□□□ 0.334e-7■■□□□ 13.1
HLTFQ14527 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.294e-7■■□□□ 13.1
HLTFQ14527 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.24e-7■■□□□ 13.1
HLTFQ14527 LYPLAL1-203ENST00000460522 1703 ntTSL 218.81■□□□□ 0.61e-6■■□□□ 13.1
HLTFQ14527 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.521e-6■■□□□ 13.1
HLTFQ14527 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.471e-6■■□□□ 13.1
HLTFQ14527 LYPLAL1-208ENST00000477938 1715 ntTSL 217.92■□□□□ 0.461e-6■■□□□ 13.1
HLTFQ14527 LYPLAL1-211ENST00000483635 2169 ntTSL 315.77■□□□□ 0.121e-6■■□□□ 13.1
HLTFQ14527 LYPLAL1-204ENST00000463964 1874 ntTSL 38.36□□□□□ -1.071e-6■■□□□ 13.1
HLTFQ14527 LYPLAL1-206ENST00000474379 1662 ntTSL 1 (best)7.83□□□□□ -1.161e-6■■□□□ 13.1
HLTFQ14527 LYPLAL1-209ENST00000478794 475 ntTSL 23.76□□□□□ -1.811e-6■■□□□ 13.1
HLTFQ14527 LYPLAL1-205ENST00000469590 1701 ntTSL 32.74□□□□□ -1.971e-6■■□□□ 13.1
HLTFQ14527 PRPF4B-206ENST00000481109 2364 ntTSL 1 (best)11.11□□□□□ -0.631e-6■■□□□ 13.1
HLTFQ14527 PRPF4B-203ENST00000463634 2590 ntTSL 58.67□□□□□ -1.021e-6■■□□□ 13.1
HLTFQ14527 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.192e-6■■□□□ 13.1
HLTFQ14527 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.362e-6■■□□□ 13.1
HLTFQ14527 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.382e-6■■□□□ 13.1
HLTFQ14527 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.442e-6■■□□□ 13.1
HLTFQ14527 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.097e-7■■□□□ 13.1
HLTFQ14527 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.234e-9■■□□□ 13.1
HLTFQ14527 AL109613.1-204ENST00000412628 172 ntTSL 35.63□□□□□ -1.514e-9■■□□□ 13.1
HLTFQ14527 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.632e-7■■□□□ 13.1
HLTFQ14527 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.494e-7■■□□□ 13.1
HLTFQ14527 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.864e-7■■□□□ 13.1
HLTFQ14527 JMJD1C-203ENST00000402544 8011 ntTSL 1 (best)2.71□□□□□ -1.984e-7■■□□□ 13.1
HLTFQ14527 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.124e-7■■□□□ 13.1
HLTFQ14527 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.781e-8■■□□□ 13.1
HLTFQ14527 GOLGA4-202ENST00000361924 7772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.211e-8■■□□□ 13.1
HLTFQ14527 GOLGA4-201ENST00000356847 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.281e-8■■□□□ 13.1
HLTFQ14527 GOLGA4-207ENST00000437131 6947 ntTSL 1 (best)2.4□□□□□ -2.021e-8■■□□□ 13.1
HLTFQ14527 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.832e-6■■□□□ 13
HLTFQ14527 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.312e-6■■□□□ 13
HLTFQ14527 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.232e-6■■□□□ 13
HLTFQ14527 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.212e-6■■□□□ 13
HLTFQ14527 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.152e-6■■□□□ 13
HLTFQ14527 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.022e-6■■□□□ 13
HLTFQ14527 AFDN-207ENST00000400822 7593 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.42e-6■■□□□ 13
HLTFQ14527 AFDN-204ENST00000366809 4839 ntTSL 1 (best)11.19□□□□□ -0.622e-6■■□□□ 13
HLTFQ14527 AFDN-210ENST00000423229 1807 ntTSL 1 (best)8.29□□□□□ -1.082e-6■■□□□ 13
HLTFQ14527 DST-208ENST00000439203 9180 ntTSL 1 (best)2.36□□□□□ -2.031e-6■■□□□ 13
HLTFQ14527 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.941e-8■■□□□ 13
HLTFQ14527 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.691e-8■■□□□ 13
HLTFQ14527 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.631e-8■■□□□ 13
HLTFQ14527 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.441e-8■■□□□ 13
HLTFQ14527 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.121e-8■■□□□ 13
HLTFQ14527 RTN4-211ENST00000438462 656 ntTSL 511.35□□□□□ -0.591e-8■■□□□ 13
HLTFQ14527 RTN4-206ENST00000394611 4161 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.81e-8■■□□□ 13
HLTFQ14527 RBM5-201ENST00000347869 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.891e-8■■□□□ 13
HLTFQ14527 RBM5-212ENST00000464087 5616 ntTSL 29.45□□□□□ -0.91e-8■■□□□ 13
HLTFQ14527 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.181e-8■■□□□ 13
HLTFQ14527 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.751e-8■■□□□ 13
HLTFQ14527 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.791e-8■■□□□ 13
HLTFQ14527 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.262e-6■■□□□ 13
HLTFQ14527 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.782e-6■■□□□ 13
HLTFQ14527 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.342e-6■■□□□ 13
HLTFQ14527 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.442e-6■■□□□ 13
HLTFQ14527 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.52e-6■■□□□ 13
HLTFQ14527 CCDC144NL-AS1-218ENST00000583962 3352 ntTSL 1 (best)12.18□□□□□ -0.461e-7■■□□□ 13
HLTFQ14527 CCDC144NL-AS1-207ENST00000577537 3727 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.561e-7■■□□□ 13
HLTFQ14527 CCDC144NL-AS1-215ENST00000582324 756 ntTSL 311.01□□□□□ -0.651e-7■■□□□ 13
HLTFQ14527 AC006141.1-201ENST00000581917 2170 ntBASIC9.1□□□□□ -0.951e-6■■□□□ 13
HLTFQ14527 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.733e-6■■□□□ 13
HLTFQ14527 FAM35A-203ENST00000437629 969 ntTSL 323.91■■□□□ 1.423e-6■■□□□ 13
HLTFQ14527 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.243e-6■■□□□ 13
HLTFQ14527 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.233e-6■■□□□ 13
HLTFQ14527 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.143e-6■■□□□ 13
HLTFQ14527 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.028e-9■■□□□ 13
HLTFQ14527 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.993e-6■■□□□ 13
HLTFQ14527 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.813e-6■■□□□ 13
HLTFQ14527 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.773e-6■■□□□ 13
HLTFQ14527 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.753e-6■■□□□ 13
HLTFQ14527 ZSWIM8-205ENST00000433366 5773 ntTSL 519.08■□□□□ 0.653e-6■■□□□ 13
HLTFQ14527 STAU2-208ENST00000520872 560 ntTSL 318.84■□□□□ 0.613e-6■■□□□ 13
HLTFQ14527 FNBP4-213ENST00000534003 2515 ntTSL 518.38■□□□□ 0.533e-6■■□□□ 13
HLTFQ14527 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.483e-6■■□□□ 13
HLTFQ14527 ZSWIM8-204ENST00000431225 1687 ntTSL 517.9■□□□□ 0.463e-6■■□□□ 13
HLTFQ14527 FANCA-206ENST00000561660 762 ntTSL 517.89■□□□□ 0.453e-6■■□□□ 13
HLTFQ14527 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.383e-6■■□□□ 13
HLTFQ14527 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.383e-6■■□□□ 13
HLTFQ14527 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.273e-6■■□□□ 13
HLTFQ14527 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.233e-6■■□□□ 13
HLTFQ14527 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.223e-6■■□□□ 13
HLTFQ14527 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.223e-6■■□□□ 13
HLTFQ14527 ABCC1-207ENST00000575422 1198 ntTSL 515.94■□□□□ 0.143e-6■■□□□ 13
HLTFQ14527 GGA3-220ENST00000613421 5156 ntTSL 215.63■□□□□ 0.093e-6■■□□□ 13
HLTFQ14527 FANCA-201ENST00000305699 1430 ntTSL 215.55■□□□□ 0.083e-6■■□□□ 13
Retrieved 100 of 6,978 protein–RNA pairs in 56.9 ms