Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BECN1Q14457 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BECN1Q14457 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BECN1Q14457 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BECN1Q14457 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BECN1Q14457 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BECN1Q14457 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BECN1Q14457 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BECN1Q14457 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BECN1Q14457 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BECN1Q14457 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BECN1Q14457 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BECN1Q14457 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BECN1Q14457 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BECN1Q14457 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BECN1Q14457 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BECN1Q14457 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BECN1Q14457 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BECN1Q14457 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BECN1Q14457 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BECN1Q14457 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BECN1Q14457 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BECN1Q14457 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BECN1Q14457 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BECN1Q14457 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BECN1Q14457 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BECN1Q14457 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BECN1Q14457 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BECN1Q14457 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BECN1Q14457 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BECN1Q14457 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BECN1Q14457 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BECN1Q14457 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BECN1Q14457 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BECN1Q14457 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BECN1Q14457 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BECN1Q14457 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BECN1Q14457 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BECN1Q14457 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BECN1Q14457 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BECN1Q14457 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BECN1Q14457 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BECN1Q14457 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BECN1Q14457 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BECN1Q14457 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BECN1Q14457 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BECN1Q14457 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BECN1Q14457 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BECN1Q14457 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BECN1Q14457 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BECN1Q14457 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BECN1Q14457 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
BECN1Q14457 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BECN1Q14457 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BECN1Q14457 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BECN1Q14457 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BECN1Q14457 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
BECN1Q14457 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
BECN1Q14457 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BECN1Q14457 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
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