Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRIM25Q14258 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM25Q14258 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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