Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE1CQ14123 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
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