Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CKAP5Q14008 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CKAP5Q14008 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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