Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FHL3Q13643 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.4 ms