Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CUL4BQ13620 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CUL4BQ13620 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
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