Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DNASE1L3Q13609 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms