Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PEX6Q13608 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEX6Q13608 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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