Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXE3Q13461 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXE3Q13461 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
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