Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

Predictions only

Length 3,056 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATMQ13315 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATMQ13315 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATMQ13315 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATMQ13315 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATMQ13315 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATMQ13315 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATMQ13315 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ATMQ13315 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ATMQ13315 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATMQ13315 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATMQ13315 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATMQ13315 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATMQ13315 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATMQ13315 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATMQ13315 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATMQ13315 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATMQ13315 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATMQ13315 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATMQ13315 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATMQ13315 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATMQ13315 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATMQ13315 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATMQ13315 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATMQ13315 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATMQ13315 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATMQ13315 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATMQ13315 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATMQ13315 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATMQ13315 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATMQ13315 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATMQ13315 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATMQ13315 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATMQ13315 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATMQ13315 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATMQ13315 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATMQ13315 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATMQ13315 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATMQ13315 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATMQ13315 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATMQ13315 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATMQ13315 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATMQ13315 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATMQ13315 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATMQ13315 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATMQ13315 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATMQ13315 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATMQ13315 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATMQ13315 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATMQ13315 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATMQ13315 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATMQ13315 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATMQ13315 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATMQ13315 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATMQ13315 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATMQ13315 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATMQ13315 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATMQ13315 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATMQ13315 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATMQ13315 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATMQ13315 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATMQ13315 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATMQ13315 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATMQ13315 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATMQ13315 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATMQ13315 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATMQ13315 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATMQ13315 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATMQ13315 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATMQ13315 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATMQ13315 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATMQ13315 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATMQ13315 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATMQ13315 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATMQ13315 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATMQ13315 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATMQ13315 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATMQ13315 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATMQ13315 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATMQ13315 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATMQ13315 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATMQ13315 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATMQ13315 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATMQ13315 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATMQ13315 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATMQ13315 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATMQ13315 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATMQ13315 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATMQ13315 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATMQ13315 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATMQ13315 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATMQ13315 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATMQ13315 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATMQ13315 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATMQ13315 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATMQ13315 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATMQ13315 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATMQ13315 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATMQ13315 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATMQ13315 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms