Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CBX3Q13185 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CBX3Q13185 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms