Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GRIK2Q13002 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIK2Q13002 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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