Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSTF3Q12996 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSTF3Q12996 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
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