Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TP53BP1Q12888 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TP53BP1Q12888 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TP53BP1Q12888 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TP53BP1Q12888 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TP53BP1Q12888 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TP53BP1Q12888 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TP53BP1Q12888 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TP53BP1Q12888 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TP53BP1Q12888 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TP53BP1Q12888 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TP53BP1Q12888 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TP53BP1Q12888 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TP53BP1Q12888 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TP53BP1Q12888 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TP53BP1Q12888 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TP53BP1Q12888 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TP53BP1Q12888 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TP53BP1Q12888 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TP53BP1Q12888 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TP53BP1Q12888 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TP53BP1Q12888 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TP53BP1Q12888 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TP53BP1Q12888 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TP53BP1Q12888 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TP53BP1Q12888 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TP53BP1Q12888 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TP53BP1Q12888 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TP53BP1Q12888 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TP53BP1Q12888 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TP53BP1Q12888 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TP53BP1Q12888 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TP53BP1Q12888 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TP53BP1Q12888 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TP53BP1Q12888 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TP53BP1Q12888 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TP53BP1Q12888 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TP53BP1Q12888 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TP53BP1Q12888 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TP53BP1Q12888 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TP53BP1Q12888 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TP53BP1Q12888 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TP53BP1Q12888 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TP53BP1Q12888 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TP53BP1Q12888 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TP53BP1Q12888 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TP53BP1Q12888 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TP53BP1Q12888 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TP53BP1Q12888 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TP53BP1Q12888 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TP53BP1Q12888 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TP53BP1Q12888 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TP53BP1Q12888 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TP53BP1Q12888 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TP53BP1Q12888 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TP53BP1Q12888 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TP53BP1Q12888 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TP53BP1Q12888 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TP53BP1Q12888 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TP53BP1Q12888 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TP53BP1Q12888 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TP53BP1Q12888 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TP53BP1Q12888 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TP53BP1Q12888 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TP53BP1Q12888 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TP53BP1Q12888 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TP53BP1Q12888 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TP53BP1Q12888 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TP53BP1Q12888 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TP53BP1Q12888 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TP53BP1Q12888 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TP53BP1Q12888 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TP53BP1Q12888 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TP53BP1Q12888 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TP53BP1Q12888 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TP53BP1Q12888 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TP53BP1Q12888 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TP53BP1Q12888 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TP53BP1Q12888 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TP53BP1Q12888 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TP53BP1Q12888 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TP53BP1Q12888 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TP53BP1Q12888 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TP53BP1Q12888 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TP53BP1Q12888 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TP53BP1Q12888 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TP53BP1Q12888 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TP53BP1Q12888 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TP53BP1Q12888 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TP53BP1Q12888 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TP53BP1Q12888 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TP53BP1Q12888 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TP53BP1Q12888 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TP53BP1Q12888 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TP53BP1Q12888 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TP53BP1Q12888 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TP53BP1Q12888 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms