Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
STX4Q12846 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
STX4Q12846 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
STX4Q12846 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
STX4Q12846 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
STX4Q12846 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
STX4Q12846 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
STX4Q12846 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
STX4Q12846 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
STX4Q12846 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
STX4Q12846 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
STX4Q12846 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
STX4Q12846 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
STX4Q12846 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
STX4Q12846 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
STX4Q12846 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
STX4Q12846 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
STX4Q12846 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
STX4Q12846 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
STX4Q12846 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
STX4Q12846 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
STX4Q12846 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
STX4Q12846 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
STX4Q12846 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
STX4Q12846 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
STX4Q12846 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
STX4Q12846 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
STX4Q12846 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
STX4Q12846 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
STX4Q12846 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
STX4Q12846 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
STX4Q12846 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
STX4Q12846 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
STX4Q12846 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
STX4Q12846 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
STX4Q12846 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
STX4Q12846 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
STX4Q12846 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
STX4Q12846 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
STX4Q12846 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
STX4Q12846 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
STX4Q12846 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
STX4Q12846 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
STX4Q12846 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
STX4Q12846 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
STX4Q12846 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
STX4Q12846 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
STX4Q12846 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
STX4Q12846 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
STX4Q12846 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
STX4Q12846 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
STX4Q12846 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
STX4Q12846 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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STX4Q12846 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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STX4Q12846 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
STX4Q12846 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
STX4Q12846 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
STX4Q12846 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
STX4Q12846 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
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STX4Q12846 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
STX4Q12846 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
STX4Q12846 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
STX4Q12846 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
STX4Q12846 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
STX4Q12846 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
STX4Q12846 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
STX4Q12846 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
STX4Q12846 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
STX4Q12846 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
STX4Q12846 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
STX4Q12846 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
STX4Q12846 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
STX4Q12846 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
STX4Q12846 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
STX4Q12846 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
STX4Q12846 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
STX4Q12846 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
STX4Q12846 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
STX4Q12846 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
STX4Q12846 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
STX4Q12846 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
STX4Q12846 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
STX4Q12846 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
STX4Q12846 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
STX4Q12846 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
STX4Q12846 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
STX4Q12846 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
STX4Q12846 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
STX4Q12846 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
STX4Q12846 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
STX4Q12846 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
STX4Q12846 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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