Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNA1Q09470 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms