Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C2orf54Q08AI8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C2orf54Q08AI8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms