Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TGM3Q08188 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TGM3Q08188 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms