Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRSF4Q08170 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SRSF4Q08170 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms