Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SOX4Q06945 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX4Q06945 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms