Protein–RNA interactions for Protein: Q05549

HRQ1, ATP-dependent helicase HRQ1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRQ1Q05549 tK(CUU)E1tK(CUU)E1 73 nt5.24□□□□□ -1.57
HRQ1Q05549 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt5.24□□□□□ -1.57
HRQ1Q05549 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt5.24□□□□□ -1.57
HRQ1Q05549 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt5.24□□□□□ -1.57
HRQ1Q05549 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt5.24□□□□□ -1.57
HRQ1Q05549 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt5.24□□□□□ -1.57
HRQ1Q05549 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt5.24□□□□□ -1.57
HRQ1Q05549 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt5.24□□□□□ -1.57
HRQ1Q05549 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt5.24□□□□□ -1.57
HRQ1Q05549 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt5.24□□□□□ -1.57
HRQ1Q05549 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt5.24□□□□□ -1.57
HRQ1Q05549 EMC4YGL231C 573 nt5.24□□□□□ -1.57
HRQ1Q05549 LNP1YHR192W 837 nt5.24□□□□□ -1.57
HRQ1Q05549 HMX1YLR205C 954 nt5.24□□□□□ -1.57
HRQ1Q05549 NMA1YLR328W 1206 nt5.24□□□□□ -1.57
HRQ1Q05549 YNL013CYNL013C 378 nt5.24□□□□□ -1.57
HRQ1Q05549 NRM1YNR009W 750 nt5.24□□□□□ -1.57
HRQ1Q05549 PFK27YOL136C 1194 nt5.24□□□□□ -1.57
HRQ1Q05549 BUD14YAR014C 2130 nt5.24□□□□□ -1.57
HRQ1Q05549 CTT1YGR088W 1689 nt5.24□□□□□ -1.57
HRQ1Q05549 CPS1YJL172W 1731 nt5.23□□□□□ -1.57
HRQ1Q05549 RPL35BYDL136W 363 nt5.23□□□□□ -1.57
HRQ1Q05549 SHU2YDR078C 672 nt5.23□□□□□ -1.57
HRQ1Q05549 MPO1YGL010W 525 nt5.23□□□□□ -1.57
HRQ1Q05549 GLG2YJL137C 1143 nt5.23□□□□□ -1.57
HRQ1Q05549 JLP1YLL057C 1239 nt5.23□□□□□ -1.57
HRQ1Q05549 YLR347W-AYLR347W-A 141 nt5.23□□□□□ -1.57
HRQ1Q05549 SEC14YMR079W 915 nt5.23□□□□□ -1.57
HRQ1Q05549 YMR085WYMR085W 1299 nt5.23□□□□□ -1.57
HRQ1Q05549 YNL144W-AYNL144W-A 84 nt5.23□□□□□ -1.57
HRQ1Q05549 PWR1PWR1 941 nt5.23□□□□□ -1.57
HRQ1Q05549 NOP8YOL144W 1455 nt5.23□□□□□ -1.57
HRQ1Q05549 HXT5YHR096C 1779 nt5.23□□□□□ -1.57
HRQ1Q05549 YTA12YMR089C 2478 nt5.23□□□□□ -1.57
HRQ1Q05549 YIL001WYIL001W 1542 nt5.23□□□□□ -1.57
HRQ1Q05549 URK1YNR012W 1506 nt5.23□□□□□ -1.57
HRQ1Q05549 YNR066CYNR066C 1311 nt5.23□□□□□ -1.57
HRQ1Q05549 NUP2YLR335W 2163 nt5.22□□□□□ -1.57
HRQ1Q05549 CBF5YLR175W 1452 nt5.22□□□□□ -1.57
HRQ1Q05549 UBC9YDL064W 474 nt5.22□□□□□ -1.57
HRQ1Q05549 SPT3YDR392W 1014 nt5.22□□□□□ -1.57
HRQ1Q05549 YFR045WYFR045W 930 nt5.22□□□□□ -1.57
HRQ1Q05549 SCM4YGR049W 564 nt5.22□□□□□ -1.57
HRQ1Q05549 SVP26YHR181W 687 nt5.22□□□□□ -1.57
HRQ1Q05549 SAP30YMR263W 606 nt5.22□□□□□ -1.57
HRQ1Q05549 MRPL17YNL252C 846 nt5.22□□□□□ -1.57
HRQ1Q05549 RAD53YPL153C 2466 nt5.22□□□□□ -1.57
HRQ1Q05549 CAB3YKL088W 1716 nt5.22□□□□□ -1.57
HRQ1Q05549 MSC2YDR205W 2175 nt5.22□□□□□ -1.57
HRQ1Q05549 SWI3YJL176C 2478 nt5.21□□□□□ -1.57
HRQ1Q05549 TUL1YKL034W 2277 nt5.21□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 DBF2YGR092W 1719 nt5.21□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 YCL076WYCL076W 744 nt5.21□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 RPL27AYHR010W 411 nt5.21□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt5.21□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 YMR099CYMR099C 894 nt5.21□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 PRX1YBL064C 786 nt5.21□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 CDC21YOR074C 915 nt5.21□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 YOR314WYOR314W 330 nt5.21□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 RTK1YDL025C 1863 nt5.21□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 MMT1YMR177W 1533 nt5.21□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 PMS1YNL082W 2622 nt5.21□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 BI3Q0115 1554 nt5.21□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt5.2□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 SWC3YAL011W 1878 nt5.2□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 MET4YNL103W 2019 nt5.2□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 NHP10YDL002C 612 nt5.2□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 YDL012CYDL012C 324 nt5.2□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 TYW3YGL050W 822 nt5.2□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 YIL021C-AYIL021C-A 270 nt5.2□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 COA3YJL062W-A 258 nt5.2□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 NYV1YLR093C 762 nt5.2□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 IMP2YMR035W 534 nt5.2□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 RUF22RUF22 515 nt5.2□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 SYC1YOR179C 567 nt5.2□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 FEX1YOR390W 1128 nt5.2□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 SUR1YPL057C 1149 nt5.2□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 FEX2YPL279C 1128 nt5.2□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 ARG4YHR018C 1392 nt5.19□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 RPL13AYDL082W 600 nt5.19□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 RUB1YDR139C 234 nt5.19□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 YDR203WYDR203W 318 nt5.19□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 COS12YGL263W 1143 nt5.19□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 APQ13YJL075C 417 nt5.19□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 SDS22YKL193C 1017 nt5.19□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 NRK1YNL129W 723 nt5.19□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 YBR056W-AYBR056W-A 201 nt5.19□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 PDR15YDR406W 4590 nt5.19□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 NUP116YMR047C 3342 nt5.18□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 NMD3YHR170W 1557 nt5.18□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 GAS3YMR215W 1575 nt5.18□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 URA3YEL021W 804 nt5.18□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 AIM25YJR100C 984 nt5.18□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 YOR338WYOR338W 1092 nt5.18□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 CIN2YPL241C 807 nt5.18□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 ALG6YOR002W 1635 nt5.18□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 HSP82YPL240C 2130 nt5.18□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 NGL3YML118W 1518 nt5.18□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 TDA3YHR009C 1572 nt5.17□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 PAN1YIR006C 4443 nt5.17□□□□□ -1.58
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