Protein–RNA interactions for Protein: Q05048

CSTF1, Cleavage stimulation factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF1Q05048 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSTF1Q05048 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSTF1Q05048 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms