Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP4A11Q02928 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP4A11Q02928 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP4A11Q02928 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP4A11Q02928 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP4A11Q02928 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP4A11Q02928 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP4A11Q02928 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP4A11Q02928 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP4A11Q02928 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP4A11Q02928 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP4A11Q02928 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP4A11Q02928 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP4A11Q02928 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP4A11Q02928 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP4A11Q02928 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP4A11Q02928 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP4A11Q02928 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP4A11Q02928 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP4A11Q02928 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP4A11Q02928 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP4A11Q02928 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP4A11Q02928 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP4A11Q02928 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP4A11Q02928 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP4A11Q02928 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP4A11Q02928 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP4A11Q02928 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP4A11Q02928 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP4A11Q02928 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CYP4A11Q02928 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CYP4A11Q02928 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms