Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
IRF8Q02556 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF8Q02556 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms