Protein–RNA interactions for Protein: Q02505

MUC3A, Mucin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 3,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC3AQ02505 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MUC3AQ02505 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MUC3AQ02505 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MUC3AQ02505 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MUC3AQ02505 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MUC3AQ02505 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MUC3AQ02505 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MUC3AQ02505 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MUC3AQ02505 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MUC3AQ02505 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MUC3AQ02505 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MUC3AQ02505 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MUC3AQ02505 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MUC3AQ02505 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MUC3AQ02505 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MUC3AQ02505 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MUC3AQ02505 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MUC3AQ02505 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MUC3AQ02505 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MUC3AQ02505 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MUC3AQ02505 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MUC3AQ02505 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MUC3AQ02505 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MUC3AQ02505 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MUC3AQ02505 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MUC3AQ02505 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MUC3AQ02505 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MUC3AQ02505 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MUC3AQ02505 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MUC3AQ02505 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MUC3AQ02505 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MUC3AQ02505 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MUC3AQ02505 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MUC3AQ02505 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MUC3AQ02505 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MUC3AQ02505 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MUC3AQ02505 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MUC3AQ02505 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MUC3AQ02505 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MUC3AQ02505 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MUC3AQ02505 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MUC3AQ02505 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MUC3AQ02505 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MUC3AQ02505 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MUC3AQ02505 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MUC3AQ02505 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MUC3AQ02505 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MUC3AQ02505 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MUC3AQ02505 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MUC3AQ02505 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MUC3AQ02505 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MUC3AQ02505 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MUC3AQ02505 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MUC3AQ02505 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MUC3AQ02505 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MUC3AQ02505 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms