Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SPIBQ01892 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms