Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
MS4A2Q01362 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MS4A2Q01362 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms