Protein–RNA interactions for Protein: P78549

NTHL1, Endonuclease III-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTHL1P78549 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NTHL1P78549 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NTHL1P78549 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NTHL1P78549 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NTHL1P78549 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NTHL1P78549 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NTHL1P78549 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NTHL1P78549 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NTHL1P78549 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NTHL1P78549 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NTHL1P78549 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NTHL1P78549 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NTHL1P78549 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NTHL1P78549 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NTHL1P78549 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NTHL1P78549 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NTHL1P78549 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NTHL1P78549 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NTHL1P78549 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NTHL1P78549 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NTHL1P78549 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NTHL1P78549 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NTHL1P78549 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms