Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRX1P78414 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRX1P78414 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRX1P78414 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRX1P78414 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRX1P78414 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRX1P78414 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRX1P78414 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRX1P78414 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRX1P78414 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRX1P78414 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IRX1P78414 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IRX1P78414 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
IRX1P78414 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRX1P78414 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IRX1P78414 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRX1P78414 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRX1P78414 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRX1P78414 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRX1P78414 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRX1P78414 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.32■■□□□ 1
IRX1P78414 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRX1P78414 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRX1P78414 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRX1P78414 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRX1P78414 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRX1P78414 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
IRX1P78414 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.32■■□□□ 1
IRX1P78414 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
IRX1P78414 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IRX1P78414 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IRX1P78414 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRX1P78414 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IRX1P78414 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IRX1P78414 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRX1P78414 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRX1P78414 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRX1P78414 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRX1P78414 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRX1P78414 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRX1P78414 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRX1P78414 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IRX1P78414 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IRX1P78414 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IRX1P78414 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.31■■□□□ 1
IRX1P78414 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IRX1P78414 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRX1P78414 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IRX1P78414 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
IRX1P78414 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IRX1P78414 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRX1P78414 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IRX1P78414 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRX1P78414 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRX1P78414 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRX1P78414 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRX1P78414 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
IRX1P78414 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
IRX1P78414 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IRX1P78414 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRX1P78414 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IRX1P78414 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRX1P78414 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRX1P78414 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IRX1P78414 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRX1P78414 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRX1P78414 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IRX1P78414 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IRX1P78414 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IRX1P78414 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IRX1P78414 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IRX1P78414 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
IRX1P78414 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IRX1P78414 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRX1P78414 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRX1P78414 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRX1P78414 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRX1P78414 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IRX1P78414 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IRX1P78414 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IRX1P78414 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRX1P78414 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRX1P78414 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IRX1P78414 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IRX1P78414 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRX1P78414 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRX1P78414 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IRX1P78414 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRX1P78414 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IRX1P78414 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRX1P78414 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IRX1P78414 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IRX1P78414 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRX1P78414 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRX1P78414 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRX1P78414 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IRX1P78414 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRX1P78414 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IRX1P78414 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IRX1P78414 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms