Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACTA2P62736 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACTA2P62736 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACTA2P62736 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACTA2P62736 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ACTA2P62736 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTA2P62736 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTA2P62736 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTA2P62736 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTA2P62736 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTA2P62736 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTA2P62736 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTA2P62736 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTA2P62736 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTA2P62736 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTA2P62736 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTA2P62736 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTA2P62736 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTA2P62736 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ACTA2P62736 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACTA2P62736 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACTA2P62736 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACTA2P62736 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACTA2P62736 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACTA2P62736 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACTA2P62736 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTA2P62736 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms