Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HERVK_113P62684 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HERVK_113P62684 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms