Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHMP4BP1P59074 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHMP4BP1P59074 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms