Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC01547P58512 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC01547P58512 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC01547P58512 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC01547P58512 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC01547P58512 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC01547P58512 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC01547P58512 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC01547P58512 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC01547P58512 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC01547P58512 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC01547P58512 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC01547P58512 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC01547P58512 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC01547P58512 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC01547P58512 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC01547P58512 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC01547P58512 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC01547P58512 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC01547P58512 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC01547P58512 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC01547P58512 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC01547P58512 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC01547P58512 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC01547P58512 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC01547P58512 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC01547P58512 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC01547P58512 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC01547P58512 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC01547P58512 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC01547P58512 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC01547P58512 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC01547P58512 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC01547P58512 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC01547P58512 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC01547P58512 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC01547P58512 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC01547P58512 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC01547P58512 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC01547P58512 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC01547P58512 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC01547P58512 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC01547P58512 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC01547P58512 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC01547P58512 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC01547P58512 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC01547P58512 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC01547P58512 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms