Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJA9P57773 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJA9P57773 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJA9P57773 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJA9P57773 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJA9P57773 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJA9P57773 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJA9P57773 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJA9P57773 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJA9P57773 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJA9P57773 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GJA9P57773 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJA9P57773 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJA9P57773 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJA9P57773 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJA9P57773 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJA9P57773 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJA9P57773 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GJA9P57773 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GJA9P57773 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJA9P57773 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJA9P57773 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJA9P57773 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GJA9P57773 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GJA9P57773 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJA9P57773 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJA9P57773 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJA9P57773 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GJA9P57773 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJA9P57773 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJA9P57773 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJA9P57773 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJA9P57773 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GJA9P57773 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJA9P57773 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJA9P57773 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJA9P57773 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GJA9P57773 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJA9P57773 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJA9P57773 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJA9P57773 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJA9P57773 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJA9P57773 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJA9P57773 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJA9P57773 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJA9P57773 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJA9P57773 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GJA9P57773 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJA9P57773 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJA9P57773 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJA9P57773 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJA9P57773 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJA9P57773 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJA9P57773 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJA9P57773 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJA9P57773 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJA9P57773 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJA9P57773 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJA9P57773 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJA9P57773 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJA9P57773 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJA9P57773 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJA9P57773 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJA9P57773 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GJA9P57773 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJA9P57773 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJA9P57773 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJA9P57773 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJA9P57773 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJA9P57773 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJA9P57773 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJA9P57773 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJA9P57773 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJA9P57773 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GJA9P57773 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GJA9P57773 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GJA9P57773 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
GJA9P57773 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJA9P57773 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GJA9P57773 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJA9P57773 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJA9P57773 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GJA9P57773 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJA9P57773 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJA9P57773 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GJA9P57773 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJA9P57773 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJA9P57773 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJA9P57773 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJA9P57773 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJA9P57773 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJA9P57773 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GJA9P57773 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GJA9P57773 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJA9P57773 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJA9P57773 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJA9P57773 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJA9P57773 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJA9P57773 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJA9P57773 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms