Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EEFSECP57772 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EEFSECP57772 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EEFSECP57772 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EEFSECP57772 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
EEFSECP57772 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EEFSECP57772 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EEFSECP57772 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EEFSECP57772 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EEFSECP57772 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EEFSECP57772 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EEFSECP57772 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EEFSECP57772 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EEFSECP57772 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EEFSECP57772 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EEFSECP57772 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EEFSECP57772 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EEFSECP57772 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
EEFSECP57772 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EEFSECP57772 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EEFSECP57772 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EEFSECP57772 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
EEFSECP57772 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EEFSECP57772 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EEFSECP57772 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EEFSECP57772 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EEFSECP57772 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EEFSECP57772 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EEFSECP57772 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EEFSECP57772 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
EEFSECP57772 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
EEFSECP57772 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
EEFSECP57772 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
EEFSECP57772 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
EEFSECP57772 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EEFSECP57772 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EEFSECP57772 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EEFSECP57772 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EEFSECP57772 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EEFSECP57772 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EEFSECP57772 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EEFSECP57772 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EEFSECP57772 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EEFSECP57772 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EEFSECP57772 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EEFSECP57772 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EEFSECP57772 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EEFSECP57772 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EEFSECP57772 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EEFSECP57772 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EEFSECP57772 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EEFSECP57772 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EEFSECP57772 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
EEFSECP57772 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EEFSECP57772 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EEFSECP57772 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EEFSECP57772 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EEFSECP57772 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms