Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLF3P57682 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLF3P57682 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLF3P57682 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLF3P57682 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLF3P57682 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF3P57682 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF3P57682 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF3P57682 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF3P57682 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF3P57682 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF3P57682 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF3P57682 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF3P57682 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF3P57682 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF3P57682 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF3P57682 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF3P57682 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLF3P57682 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF3P57682 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF3P57682 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF3P57682 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF3P57682 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF3P57682 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF3P57682 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF3P57682 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF3P57682 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF3P57682 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF3P57682 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF3P57682 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF3P57682 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF3P57682 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF3P57682 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF3P57682 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF3P57682 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF3P57682 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLF3P57682 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF3P57682 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF3P57682 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF3P57682 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF3P57682 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF3P57682 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF3P57682 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF3P57682 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF3P57682 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF3P57682 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF3P57682 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF3P57682 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF3P57682 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF3P57682 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF3P57682 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLF3P57682 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF3P57682 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF3P57682 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF3P57682 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF3P57682 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF3P57682 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF3P57682 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF3P57682 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF3P57682 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF3P57682 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF3P57682 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF3P57682 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF3P57682 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF3P57682 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF3P57682 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF3P57682 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLF3P57682 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLF3P57682 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLF3P57682 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLF3P57682 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLF3P57682 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLF3P57682 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLF3P57682 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLF3P57682 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLF3P57682 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
KLF3P57682 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLF3P57682 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLF3P57682 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLF3P57682 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLF3P57682 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLF3P57682 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLF3P57682 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLF3P57682 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLF3P57682 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLF3P57682 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
KLF3P57682 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLF3P57682 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLF3P57682 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLF3P57682 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLF3P57682 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLF3P57682 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLF3P57682 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLF3P57682 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLF3P57682 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLF3P57682 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLF3P57682 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLF3P57682 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLF3P57682 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
KLF3P57682 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms