Protein–RNA interactions for Protein: P56589

PEX3, Peroxisomal biogenesis factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX3P56589 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PEX3P56589 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PEX3P56589 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PEX3P56589 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PEX3P56589 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PEX3P56589 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PEX3P56589 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PEX3P56589 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PEX3P56589 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PEX3P56589 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PEX3P56589 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PEX3P56589 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PEX3P56589 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PEX3P56589 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PEX3P56589 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PEX3P56589 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PEX3P56589 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PEX3P56589 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PEX3P56589 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PEX3P56589 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PEX3P56589 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PEX3P56589 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PEX3P56589 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PEX3P56589 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PEX3P56589 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PEX3P56589 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PEX3P56589 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PEX3P56589 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PEX3P56589 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PEX3P56589 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PEX3P56589 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PEX3P56589 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PEX3P56589 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PEX3P56589 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PEX3P56589 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PEX3P56589 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PEX3P56589 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PEX3P56589 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PEX3P56589 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PEX3P56589 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PEX3P56589 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PEX3P56589 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PEX3P56589 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PEX3P56589 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PEX3P56589 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PEX3P56589 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PEX3P56589 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PEX3P56589 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PEX3P56589 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PEX3P56589 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PEX3P56589 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PEX3P56589 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PEX3P56589 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PEX3P56589 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PEX3P56589 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PEX3P56589 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PEX3P56589 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PEX3P56589 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PEX3P56589 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PEX3P56589 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PEX3P56589 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PEX3P56589 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PEX3P56589 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PEX3P56589 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PEX3P56589 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PEX3P56589 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PEX3P56589 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PEX3P56589 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PEX3P56589 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PEX3P56589 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PEX3P56589 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PEX3P56589 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PEX3P56589 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PEX3P56589 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PEX3P56589 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PEX3P56589 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PEX3P56589 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PEX3P56589 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PEX3P56589 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PEX3P56589 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PEX3P56589 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PEX3P56589 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PEX3P56589 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEX3P56589 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEX3P56589 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEX3P56589 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEX3P56589 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEX3P56589 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEX3P56589 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEX3P56589 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEX3P56589 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEX3P56589 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PEX3P56589 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PEX3P56589 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PEX3P56589 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PEX3P56589 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PEX3P56589 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PEX3P56589 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PEX3P56589 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PEX3P56589 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms