Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
OXCT1P55809 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
OXCT1P55809 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms