Protein–RNA interactions for Protein: P54849

EMP1, Epithelial membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP1P54849 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EMP1P54849 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EMP1P54849 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EMP1P54849 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EMP1P54849 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EMP1P54849 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EMP1P54849 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EMP1P54849 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
EMP1P54849 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EMP1P54849 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EMP1P54849 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EMP1P54849 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EMP1P54849 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EMP1P54849 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EMP1P54849 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EMP1P54849 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EMP1P54849 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EMP1P54849 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EMP1P54849 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EMP1P54849 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EMP1P54849 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EMP1P54849 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EMP1P54849 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EMP1P54849 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EMP1P54849 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EMP1P54849 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EMP1P54849 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EMP1P54849 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EMP1P54849 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EMP1P54849 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EMP1P54849 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EMP1P54849 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EMP1P54849 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EMP1P54849 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EMP1P54849 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EMP1P54849 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EMP1P54849 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EMP1P54849 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EMP1P54849 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EMP1P54849 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EMP1P54849 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EMP1P54849 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EMP1P54849 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EMP1P54849 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EMP1P54849 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMP1P54849 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMP1P54849 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMP1P54849 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMP1P54849 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMP1P54849 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMP1P54849 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EMP1P54849 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMP1P54849 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMP1P54849 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMP1P54849 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMP1P54849 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMP1P54849 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMP1P54849 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMP1P54849 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMP1P54849 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMP1P54849 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EMP1P54849 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMP1P54849 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMP1P54849 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMP1P54849 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMP1P54849 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMP1P54849 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EMP1P54849 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMP1P54849 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMP1P54849 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMP1P54849 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMP1P54849 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMP1P54849 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMP1P54849 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMP1P54849 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMP1P54849 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EMP1P54849 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMP1P54849 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMP1P54849 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMP1P54849 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EMP1P54849 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EMP1P54849 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EMP1P54849 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EMP1P54849 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EMP1P54849 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EMP1P54849 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EMP1P54849 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EMP1P54849 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EMP1P54849 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EMP1P54849 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EMP1P54849 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EMP1P54849 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EMP1P54849 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EMP1P54849 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EMP1P54849 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EMP1P54849 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EMP1P54849 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EMP1P54849 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EMP1P54849 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EMP1P54849 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms