Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
POLR2KP53803 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2KP53803 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms