Protein–RNA interactions for Protein: P53673

CRYBA4, Beta-crystallin A4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBA4P53673 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CRYBA4P53673 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CRYBA4P53673 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CRYBA4P53673 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CRYBA4P53673 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRYBA4P53673 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRYBA4P53673 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRYBA4P53673 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CRYBA4P53673 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms