Protein–RNA interactions for Protein: P53634

CTSC, Dipeptidyl peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSCP53634 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTSCP53634 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTSCP53634 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTSCP53634 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTSCP53634 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTSCP53634 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTSCP53634 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTSCP53634 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTSCP53634 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTSCP53634 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTSCP53634 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTSCP53634 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTSCP53634 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTSCP53634 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTSCP53634 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTSCP53634 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTSCP53634 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CTSCP53634 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTSCP53634 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTSCP53634 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTSCP53634 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTSCP53634 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTSCP53634 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTSCP53634 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTSCP53634 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTSCP53634 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTSCP53634 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTSCP53634 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTSCP53634 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTSCP53634 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTSCP53634 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTSCP53634 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTSCP53634 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTSCP53634 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTSCP53634 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTSCP53634 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTSCP53634 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTSCP53634 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTSCP53634 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTSCP53634 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CTSCP53634 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTSCP53634 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTSCP53634 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTSCP53634 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTSCP53634 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTSCP53634 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTSCP53634 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTSCP53634 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTSCP53634 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTSCP53634 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTSCP53634 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CTSCP53634 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CTSCP53634 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTSCP53634 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTSCP53634 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CTSCP53634 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTSCP53634 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTSCP53634 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTSCP53634 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTSCP53634 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CTSCP53634 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CTSCP53634 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTSCP53634 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTSCP53634 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CTSCP53634 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTSCP53634 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTSCP53634 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTSCP53634 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTSCP53634 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTSCP53634 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTSCP53634 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTSCP53634 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTSCP53634 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTSCP53634 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTSCP53634 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTSCP53634 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSCP53634 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSCP53634 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSCP53634 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSCP53634 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSCP53634 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSCP53634 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSCP53634 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSCP53634 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSCP53634 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSCP53634 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSCP53634 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSCP53634 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSCP53634 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSCP53634 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSCP53634 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSCP53634 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSCP53634 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSCP53634 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSCP53634 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSCP53634 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSCP53634 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSCP53634 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSCP53634 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSCP53634 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms