Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GTF2A1P52655 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GTF2A1P52655 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GTF2A1P52655 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GTF2A1P52655 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GTF2A1P52655 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
GTF2A1P52655 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GTF2A1P52655 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2A1P52655 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2A1P52655 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2A1P52655 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2A1P52655 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2A1P52655 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2A1P52655 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2A1P52655 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2A1P52655 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2A1P52655 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTF2A1P52655 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2A1P52655 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2A1P52655 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2A1P52655 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2A1P52655 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2A1P52655 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2A1P52655 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2A1P52655 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2A1P52655 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2A1P52655 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2A1P52655 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2A1P52655 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2A1P52655 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2A1P52655 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2A1P52655 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2A1P52655 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2A1P52655 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GTF2A1P52655 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2A1P52655 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2A1P52655 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2A1P52655 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GTF2A1P52655 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2A1P52655 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2A1P52655 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2A1P52655 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2A1P52655 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2A1P52655 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2A1P52655 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2A1P52655 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2A1P52655 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2A1P52655 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GTF2A1P52655 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2A1P52655 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2A1P52655 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2A1P52655 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2A1P52655 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2A1P52655 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2A1P52655 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2A1P52655 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2A1P52655 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2A1P52655 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2A1P52655 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2A1P52655 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GTF2A1P52655 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2A1P52655 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2A1P52655 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2A1P52655 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTF2A1P52655 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2A1P52655 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2A1P52655 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2A1P52655 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2A1P52655 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2A1P52655 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2A1P52655 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2A1P52655 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms