Protein–RNA interactions for Protein: P51825

AFF1, AF4/FMR2 family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF1P51825 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AFF1P51825 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFF1P51825 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFF1P51825 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFF1P51825 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFF1P51825 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFF1P51825 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFF1P51825 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFF1P51825 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AFF1P51825 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AFF1P51825 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AFF1P51825 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AFF1P51825 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
AFF1P51825 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AFF1P51825 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AFF1P51825 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AFF1P51825 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AFF1P51825 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
AFF1P51825 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
AFF1P51825 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
AFF1P51825 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
AFF1P51825 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
AFF1P51825 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
AFF1P51825 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
AFF1P51825 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFF1P51825 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFF1P51825 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFF1P51825 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFF1P51825 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFF1P51825 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFF1P51825 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFF1P51825 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
AFF1P51825 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFF1P51825 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFF1P51825 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AFF1P51825 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFF1P51825 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFF1P51825 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFF1P51825 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFF1P51825 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFF1P51825 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFF1P51825 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFF1P51825 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFF1P51825 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFF1P51825 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFF1P51825 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AFF1P51825 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFF1P51825 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFF1P51825 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFF1P51825 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFF1P51825 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFF1P51825 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFF1P51825 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFF1P51825 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFF1P51825 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFF1P51825 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFF1P51825 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFF1P51825 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFF1P51825 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFF1P51825 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFF1P51825 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFF1P51825 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFF1P51825 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFF1P51825 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
AFF1P51825 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFF1P51825 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFF1P51825 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AFF1P51825 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFF1P51825 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFF1P51825 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFF1P51825 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFF1P51825 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFF1P51825 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFF1P51825 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFF1P51825 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFF1P51825 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AFF1P51825 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AFF1P51825 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AFF1P51825 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AFF1P51825 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AFF1P51825 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AFF1P51825 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AFF1P51825 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AFF1P51825 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AFF1P51825 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AFF1P51825 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AFF1P51825 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AFF1P51825 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AFF1P51825 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AFF1P51825 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AFF1P51825 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AFF1P51825 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AFF1P51825 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AFF1P51825 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AFF1P51825 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AFF1P51825 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AFF1P51825 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AFF1P51825 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AFF1P51825 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AFF1P51825 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms