Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRIM1P49642 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRIM1P49642 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRIM1P49642 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRIM1P49642 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRIM1P49642 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRIM1P49642 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRIM1P49642 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRIM1P49642 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRIM1P49642 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRIM1P49642 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PRIM1P49642 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRIM1P49642 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRIM1P49642 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRIM1P49642 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRIM1P49642 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRIM1P49642 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRIM1P49642 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRIM1P49642 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRIM1P49642 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRIM1P49642 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRIM1P49642 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRIM1P49642 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRIM1P49642 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRIM1P49642 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRIM1P49642 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRIM1P49642 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRIM1P49642 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRIM1P49642 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRIM1P49642 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRIM1P49642 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRIM1P49642 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRIM1P49642 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PRIM1P49642 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRIM1P49642 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRIM1P49642 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRIM1P49642 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PRIM1P49642 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRIM1P49642 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRIM1P49642 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRIM1P49642 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRIM1P49642 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRIM1P49642 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRIM1P49642 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRIM1P49642 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRIM1P49642 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRIM1P49642 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRIM1P49642 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRIM1P49642 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRIM1P49642 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRIM1P49642 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRIM1P49642 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PRIM1P49642 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PRIM1P49642 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PRIM1P49642 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRIM1P49642 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRIM1P49642 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRIM1P49642 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRIM1P49642 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PRIM1P49642 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRIM1P49642 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRIM1P49642 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRIM1P49642 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRIM1P49642 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRIM1P49642 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRIM1P49642 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRIM1P49642 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRIM1P49642 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PRIM1P49642 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRIM1P49642 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRIM1P49642 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRIM1P49642 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRIM1P49642 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRIM1P49642 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRIM1P49642 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PRIM1P49642 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRIM1P49642 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PRIM1P49642 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRIM1P49642 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRIM1P49642 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRIM1P49642 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PRIM1P49642 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRIM1P49642 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRIM1P49642 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRIM1P49642 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRIM1P49642 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PRIM1P49642 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRIM1P49642 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRIM1P49642 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRIM1P49642 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRIM1P49642 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRIM1P49642 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRIM1P49642 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms